История Мухоршибирского районного суда Республики Бурятия берет свое начало в 1927 году, когда Президиум ВЦИК Бурят-Монгольской АССР принял постановление об образовании Мухоршибирского аймака. Для Мухоршибирского народного суда было выделено помещение, ранее принадлежавшее местному купцу. Это был одноэтажный деревянный особняк в центре села Мухоршибирь. Народный суд рассматривал уголовные дела, занимался гражданскими и трудовыми спорами. После принятия Конституции СССР в 1936 году был введен институт народных заседателей. На народные суды, с проведением широкой коллективизации, была возложена задача в виде помощи колхозам в их становлении, в пресечении попыток растрачивания общественного имущества. Суд руководствовался не только УК, но и Указами, которые принимались ВЦИКом СССР.

В сохранившихся судебных документах указано, что в военное время только один судья Харенко исполнял свои обязанности, только в 1943 году должность народного судьи была выбрана Печугина, ранее работавшая секретарем суда. В годы войны народный суд нуждался в самом необходимом - канцелярских товарах. Приговоры писались на старых обоях и бухгалтерских бланках.

В послевоенные годы шла активная пропаганда народного суда, в газетах велись рубрики, освещающие сведения о рассмотренных уголовных делах. В 1946 году народным судьей Мухоршибирского района была выбрана Колдина, долгое время исполнявшая свои обязанности по отправлению правосудия.

В 50-х годах путем выборов при тайном голосовании были избраны народными судьями Демин Иннокентий Хрисанфович, участник Великой отечественной войны, награжденный за боевые заслуги орденом славы III степени и Бубеев Николай Протасович, также участник Великой Отечественной Войны. 

В 60—70-е годы судьи не только выносили решения по делам гражданского производства, но и проводили большую работу по пропаганде правовых знаний среди населения. Примером тому служит судья М. Бадуева. Негативные проявления в виде хулиганства, пьянства, мелкого хищения были актуальными темами для выступлений. Так, судья М. Бадуева постоянно выступала с публикациями в местной газете со статьями «Пьянству бой», «Пьяный человек за рулем — преступник» и т.п. Она составляла обобщения судебной практики по автотранспортным преступлениям, совершенным водителями в нетрезвом состоянии, проводила лекции и беседы среди водительского состава.

29 мая 1990 года по итогам выборов народных судей Верховный Совет Бурятской АССР принял Постановление об избрании Александра Ивановича Карелова народным судьей и в этот же день он был утвержден в должности председателя Мухоршибирского районного народного суда. До этого судьей и председателем суда был Николай Петрович Глубоков, в последующем председатель Заиграевского районного суда и судья Верховного Суда Республики Бурятия. Суд в то время был двухсоставным и к моменту избрания Александра Ивановича председателем, вторым народным судьей была С.Б. Цыренжапова, оба в настоящее время находятся в Почетной отставке. Судьями Мухоршибирского районного суда в разные годы были: в 1993-1994 гг. - А.Ф. Паньков, в последующем председатель Бичурского районного суда; Е.И. Братенькова; в 1996-2008 гг. - А.Ф. Петелин, ныне судья в почетной отставке; в 2009-2012 гг. - А.Б. Базаржапов; в 2003-2017 гг. - О.Н. Бадармаева, ныне судья в почетной отставке; в 2012-2019 гг. – И.А. Тараева, на сегодняшний день председатель Кяхтинского районного суда Республики Бурятия; в 2014-2019 гг. – Р.А. Мартынов был председателем суда.

Указом Президента Российской Федерации от 06 февраля 2004 года № 152 на 3-летний срок полномочий назначена судьей Парпаева М.Ю., переназначена на указанную должность Указом Президента Российской от 9 ноября 2007 года № 1520.

Указом Президента Российской Федерации от 18 марта 2019 года № 106 Алексеева И.Н. назначена судьей Мухоршибирского районного суда Республики Бурятия.

Указом Президента Российской Федерации от 20 февраля 2020 года № 142 Тимофеева Н.С. назначена судьей Мухоршибирского районного суда Республики Бурятия.

Указом Президента Российской Федерации от 14 сентября 2020 года № 554 судья Санданова Д.Ч. назначена председателем суда на 6-ий срок полномочий.